Protein–RNA interactions for Protein: A7XUX6

Skint2, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint2A7XUX6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Skint2A7XUX6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Skint2A7XUX6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Skint2A7XUX6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Skint2A7XUX6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Skint2A7XUX6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Skint2A7XUX6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Skint2A7XUX6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Skint2A7XUX6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Skint2A7XUX6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Skint2A7XUX6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Skint2A7XUX6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Skint2A7XUX6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Skint2A7XUX6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Skint2A7XUX6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Skint2A7XUX6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Skint2A7XUX6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Skint2A7XUX6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Skint2A7XUX6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Skint2A7XUX6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Skint2A7XUX6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Skint2A7XUX6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Skint2A7XUX6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Skint2A7XUX6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Skint2A7XUX6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Skint2A7XUX6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Skint2A7XUX6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Skint2A7XUX6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Skint2A7XUX6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Skint2A7XUX6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Skint2A7XUX6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Skint2A7XUX6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Skint2A7XUX6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skint2A7XUX6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skint2A7XUX6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skint2A7XUX6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Skint2A7XUX6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Skint2A7XUX6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Skint2A7XUX6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Skint2A7XUX6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Skint2A7XUX6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Skint2A7XUX6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Skint2A7XUX6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Skint2A7XUX6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Skint2A7XUX6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Skint2A7XUX6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Skint2A7XUX6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Skint2A7XUX6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Skint2A7XUX6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Skint2A7XUX6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Skint2A7XUX6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Skint2A7XUX6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Skint2A7XUX6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Skint2A7XUX6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Skint2A7XUX6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Skint2A7XUX6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Skint2A7XUX6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Skint2A7XUX6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Skint2A7XUX6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Skint2A7XUX6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Skint2A7XUX6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Skint2A7XUX6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Skint2A7XUX6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Skint2A7XUX6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Skint2A7XUX6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Skint2A7XUX6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Skint2A7XUX6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Skint2A7XUX6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Skint2A7XUX6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Skint2A7XUX6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Skint2A7XUX6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Skint2A7XUX6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Skint2A7XUX6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Skint2A7XUX6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Skint2A7XUX6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Skint2A7XUX6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Skint2A7XUX6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Skint2A7XUX6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Skint2A7XUX6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Skint2A7XUX6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Skint2A7XUX6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Skint2A7XUX6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Skint2A7XUX6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Skint2A7XUX6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Skint2A7XUX6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Skint2A7XUX6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Skint2A7XUX6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Skint2A7XUX6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Skint2A7XUX6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Skint2A7XUX6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Skint2A7XUX6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Skint2A7XUX6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Skint2A7XUX6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Skint2A7XUX6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Skint2A7XUX6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Skint2A7XUX6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Skint2A7XUX6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Skint2A7XUX6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Skint2A7XUX6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Skint2A7XUX6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms