Protein–RNA interactions for Protein: A6H6E9

Ttc23l, Tetratricopeptide repeat protein 23-like, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc23lA6H6E9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ttc23lA6H6E9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttc23lA6H6E9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttc23lA6H6E9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ttc23lA6H6E9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ttc23lA6H6E9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttc23lA6H6E9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttc23lA6H6E9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttc23lA6H6E9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttc23lA6H6E9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttc23lA6H6E9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttc23lA6H6E9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttc23lA6H6E9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttc23lA6H6E9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttc23lA6H6E9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttc23lA6H6E9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttc23lA6H6E9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc23lA6H6E9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc23lA6H6E9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc23lA6H6E9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc23lA6H6E9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttc23lA6H6E9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttc23lA6H6E9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ttc23lA6H6E9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ttc23lA6H6E9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ttc23lA6H6E9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ttc23lA6H6E9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ttc23lA6H6E9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc23lA6H6E9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc23lA6H6E9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc23lA6H6E9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc23lA6H6E9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc23lA6H6E9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc23lA6H6E9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc23lA6H6E9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc23lA6H6E9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc23lA6H6E9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttc23lA6H6E9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttc23lA6H6E9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttc23lA6H6E9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttc23lA6H6E9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttc23lA6H6E9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc23lA6H6E9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc23lA6H6E9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc23lA6H6E9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc23lA6H6E9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc23lA6H6E9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc23lA6H6E9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ttc23lA6H6E9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ttc23lA6H6E9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ttc23lA6H6E9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ttc23lA6H6E9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Ttc23lA6H6E9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc23lA6H6E9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc23lA6H6E9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc23lA6H6E9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc23lA6H6E9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc23lA6H6E9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttc23lA6H6E9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttc23lA6H6E9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttc23lA6H6E9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttc23lA6H6E9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttc23lA6H6E9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttc23lA6H6E9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttc23lA6H6E9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttc23lA6H6E9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttc23lA6H6E9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttc23lA6H6E9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttc23lA6H6E9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttc23lA6H6E9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttc23lA6H6E9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttc23lA6H6E9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttc23lA6H6E9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttc23lA6H6E9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttc23lA6H6E9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc23lA6H6E9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc23lA6H6E9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc23lA6H6E9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc23lA6H6E9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc23lA6H6E9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc23lA6H6E9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc23lA6H6E9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc23lA6H6E9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc23lA6H6E9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc23lA6H6E9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttc23lA6H6E9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttc23lA6H6E9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttc23lA6H6E9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttc23lA6H6E9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttc23lA6H6E9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttc23lA6H6E9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttc23lA6H6E9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttc23lA6H6E9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttc23lA6H6E9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttc23lA6H6E9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttc23lA6H6E9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttc23lA6H6E9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttc23lA6H6E9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttc23lA6H6E9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttc23lA6H6E9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 240.3 ms