Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gbp4A4UUI3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gbp4A4UUI3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gbp4A4UUI3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gbp4A4UUI3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gbp4A4UUI3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gbp4A4UUI3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gbp4A4UUI3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gbp4A4UUI3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gbp4A4UUI3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gbp4A4UUI3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gbp4A4UUI3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gbp4A4UUI3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gbp4A4UUI3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gbp4A4UUI3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gbp4A4UUI3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gbp4A4UUI3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gbp4A4UUI3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gbp4A4UUI3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gbp4A4UUI3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gbp4A4UUI3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gbp4A4UUI3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gbp4A4UUI3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gbp4A4UUI3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gbp4A4UUI3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gbp4A4UUI3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gbp4A4UUI3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gbp4A4UUI3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gbp4A4UUI3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gbp4A4UUI3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gbp4A4UUI3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gbp4A4UUI3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gbp4A4UUI3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gbp4A4UUI3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gbp4A4UUI3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gbp4A4UUI3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gbp4A4UUI3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gbp4A4UUI3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gbp4A4UUI3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gbp4A4UUI3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gbp4A4UUI3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Gbp4A4UUI3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gbp4A4UUI3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gbp4A4UUI3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gbp4A4UUI3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gbp4A4UUI3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gbp4A4UUI3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gbp4A4UUI3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gbp4A4UUI3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gbp4A4UUI3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gbp4A4UUI3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gbp4A4UUI3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gbp4A4UUI3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gbp4A4UUI3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gbp4A4UUI3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gbp4A4UUI3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gbp4A4UUI3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Gbp4A4UUI3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gbp4A4UUI3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gbp4A4UUI3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gbp4A4UUI3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gbp4A4UUI3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gbp4A4UUI3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gbp4A4UUI3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gbp4A4UUI3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gbp4A4UUI3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gbp4A4UUI3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Gbp4A4UUI3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gbp4A4UUI3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gbp4A4UUI3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gbp4A4UUI3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gbp4A4UUI3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gbp4A4UUI3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gbp4A4UUI3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gbp4A4UUI3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gbp4A4UUI3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gbp4A4UUI3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gbp4A4UUI3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gbp4A4UUI3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gbp4A4UUI3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gbp4A4UUI3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gbp4A4UUI3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gbp4A4UUI3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gbp4A4UUI3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gbp4A4UUI3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gbp4A4UUI3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Gbp4A4UUI3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gbp4A4UUI3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gbp4A4UUI3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gbp4A4UUI3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gbp4A4UUI3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gbp4A4UUI3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
Gbp4A4UUI3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gbp4A4UUI3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gbp4A4UUI3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gbp4A4UUI3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Gbp4A4UUI3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gbp4A4UUI3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gbp4A4UUI3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gbp4A4UUI3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms