Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Odf2A3KGV1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Odf2A3KGV1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Odf2A3KGV1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Odf2A3KGV1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Odf2A3KGV1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Odf2A3KGV1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Odf2A3KGV1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Odf2A3KGV1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Odf2A3KGV1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Odf2A3KGV1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Odf2A3KGV1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Odf2A3KGV1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Odf2A3KGV1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Odf2A3KGV1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Odf2A3KGV1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Odf2A3KGV1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Odf2A3KGV1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Odf2A3KGV1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Odf2A3KGV1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Odf2A3KGV1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Odf2A3KGV1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Odf2A3KGV1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Odf2A3KGV1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Odf2A3KGV1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Odf2A3KGV1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Odf2A3KGV1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Odf2A3KGV1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Odf2A3KGV1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Odf2A3KGV1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Odf2A3KGV1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Odf2A3KGV1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Odf2A3KGV1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Odf2A3KGV1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Odf2A3KGV1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Odf2A3KGV1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Odf2A3KGV1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Odf2A3KGV1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Odf2A3KGV1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Odf2A3KGV1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Odf2A3KGV1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Odf2A3KGV1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Odf2A3KGV1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Odf2A3KGV1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Odf2A3KGV1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Odf2A3KGV1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Odf2A3KGV1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Odf2A3KGV1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Odf2A3KGV1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Odf2A3KGV1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Odf2A3KGV1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Odf2A3KGV1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Odf2A3KGV1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Odf2A3KGV1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Odf2A3KGV1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Odf2A3KGV1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Odf2A3KGV1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Odf2A3KGV1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Odf2A3KGV1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Odf2A3KGV1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Odf2A3KGV1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Odf2A3KGV1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Odf2A3KGV1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Odf2A3KGV1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Odf2A3KGV1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Odf2A3KGV1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Odf2A3KGV1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Odf2A3KGV1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Odf2A3KGV1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Odf2A3KGV1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Odf2A3KGV1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Odf2A3KGV1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Odf2A3KGV1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Odf2A3KGV1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Odf2A3KGV1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Odf2A3KGV1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Odf2A3KGV1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Odf2A3KGV1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Odf2A3KGV1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Odf2A3KGV1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Odf2A3KGV1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Odf2A3KGV1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Odf2A3KGV1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Odf2A3KGV1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Odf2A3KGV1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Odf2A3KGV1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Odf2A3KGV1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Odf2A3KGV1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Odf2A3KGV1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Odf2A3KGV1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Odf2A3KGV1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Odf2A3KGV1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Odf2A3KGV1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Odf2A3KGV1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Odf2A3KGV1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Odf2A3KGV1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Odf2A3KGV1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Odf2A3KGV1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Odf2A3KGV1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Odf2A3KGV1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms