Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Palm3A2TJV2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Palm3A2TJV2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Palm3A2TJV2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Palm3A2TJV2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Palm3A2TJV2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Palm3A2TJV2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Palm3A2TJV2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Palm3A2TJV2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Palm3A2TJV2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Palm3A2TJV2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Palm3A2TJV2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Palm3A2TJV2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Palm3A2TJV2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Palm3A2TJV2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Palm3A2TJV2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Palm3A2TJV2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Palm3A2TJV2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Palm3A2TJV2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Palm3A2TJV2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Palm3A2TJV2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Palm3A2TJV2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Palm3A2TJV2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Palm3A2TJV2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Palm3A2TJV2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Palm3A2TJV2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Palm3A2TJV2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Palm3A2TJV2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Palm3A2TJV2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Palm3A2TJV2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Palm3A2TJV2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Palm3A2TJV2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Palm3A2TJV2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Palm3A2TJV2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Palm3A2TJV2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Palm3A2TJV2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Palm3A2TJV2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Palm3A2TJV2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Palm3A2TJV2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Palm3A2TJV2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Palm3A2TJV2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Palm3A2TJV2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Palm3A2TJV2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Palm3A2TJV2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Palm3A2TJV2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Palm3A2TJV2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Palm3A2TJV2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Palm3A2TJV2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Palm3A2TJV2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Palm3A2TJV2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Palm3A2TJV2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Palm3A2TJV2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Palm3A2TJV2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Palm3A2TJV2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Palm3A2TJV2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Palm3A2TJV2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Palm3A2TJV2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Palm3A2TJV2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Palm3A2TJV2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Palm3A2TJV2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Palm3A2TJV2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Palm3A2TJV2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Palm3A2TJV2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Palm3A2TJV2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Palm3A2TJV2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Palm3A2TJV2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Palm3A2TJV2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Palm3A2TJV2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Palm3A2TJV2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Palm3A2TJV2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Palm3A2TJV2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Palm3A2TJV2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Palm3A2TJV2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Palm3A2TJV2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Palm3A2TJV2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Palm3A2TJV2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Palm3A2TJV2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Palm3A2TJV2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Palm3A2TJV2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Palm3A2TJV2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Palm3A2TJV2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Palm3A2TJV2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Palm3A2TJV2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Palm3A2TJV2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Palm3A2TJV2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Palm3A2TJV2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Palm3A2TJV2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Palm3A2TJV2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Palm3A2TJV2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Palm3A2TJV2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Palm3A2TJV2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Palm3A2TJV2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Palm3A2TJV2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Palm3A2TJV2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Palm3A2TJV2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Palm3A2TJV2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Palm3A2TJV2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Palm3A2TJV2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Palm3A2TJV2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Palm3A2TJV2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.2 ms