Protein–RNA interactions for Protein: A2AV25

Fibcd1, Fibrinogen C domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fibcd1A2AV25 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fibcd1A2AV25 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fibcd1A2AV25 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fibcd1A2AV25 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fibcd1A2AV25 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fibcd1A2AV25 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fibcd1A2AV25 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fibcd1A2AV25 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fibcd1A2AV25 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Fibcd1A2AV25 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Fibcd1A2AV25 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fibcd1A2AV25 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fibcd1A2AV25 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fibcd1A2AV25 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fibcd1A2AV25 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Fibcd1A2AV25 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fibcd1A2AV25 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fibcd1A2AV25 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fibcd1A2AV25 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fibcd1A2AV25 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fibcd1A2AV25 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fibcd1A2AV25 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fibcd1A2AV25 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fibcd1A2AV25 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fibcd1A2AV25 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fibcd1A2AV25 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Fibcd1A2AV25 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fibcd1A2AV25 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fibcd1A2AV25 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fibcd1A2AV25 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fibcd1A2AV25 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fibcd1A2AV25 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fibcd1A2AV25 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fibcd1A2AV25 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fibcd1A2AV25 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fibcd1A2AV25 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fibcd1A2AV25 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fibcd1A2AV25 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fibcd1A2AV25 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fibcd1A2AV25 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Fibcd1A2AV25 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fibcd1A2AV25 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fibcd1A2AV25 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fibcd1A2AV25 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Fibcd1A2AV25 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fibcd1A2AV25 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fibcd1A2AV25 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Fibcd1A2AV25 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fibcd1A2AV25 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Fibcd1A2AV25 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fibcd1A2AV25 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fibcd1A2AV25 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fibcd1A2AV25 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fibcd1A2AV25 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fibcd1A2AV25 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fibcd1A2AV25 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Fibcd1A2AV25 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fibcd1A2AV25 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Fibcd1A2AV25 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Fibcd1A2AV25 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fibcd1A2AV25 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fibcd1A2AV25 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fibcd1A2AV25 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fibcd1A2AV25 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fibcd1A2AV25 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fibcd1A2AV25 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fibcd1A2AV25 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fibcd1A2AV25 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fibcd1A2AV25 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fibcd1A2AV25 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fibcd1A2AV25 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fibcd1A2AV25 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fibcd1A2AV25 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fibcd1A2AV25 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fibcd1A2AV25 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fibcd1A2AV25 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fibcd1A2AV25 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fibcd1A2AV25 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fibcd1A2AV25 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fibcd1A2AV25 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fibcd1A2AV25 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fibcd1A2AV25 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fibcd1A2AV25 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fibcd1A2AV25 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fibcd1A2AV25 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fibcd1A2AV25 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fibcd1A2AV25 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fibcd1A2AV25 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fibcd1A2AV25 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fibcd1A2AV25 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fibcd1A2AV25 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fibcd1A2AV25 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fibcd1A2AV25 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fibcd1A2AV25 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fibcd1A2AV25 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fibcd1A2AV25 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fibcd1A2AV25 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fibcd1A2AV25 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fibcd1A2AV25 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fibcd1A2AV25 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms