Protein–RNA interactions for Protein: A2ARM1

Patl2, Protein PAT1 homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Patl2A2ARM1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Patl2A2ARM1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Patl2A2ARM1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Patl2A2ARM1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Patl2A2ARM1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Patl2A2ARM1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Patl2A2ARM1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Patl2A2ARM1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Patl2A2ARM1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Patl2A2ARM1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Patl2A2ARM1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Patl2A2ARM1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Patl2A2ARM1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Patl2A2ARM1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Patl2A2ARM1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Patl2A2ARM1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Patl2A2ARM1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Patl2A2ARM1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Patl2A2ARM1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Patl2A2ARM1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Patl2A2ARM1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Patl2A2ARM1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Patl2A2ARM1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Patl2A2ARM1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Patl2A2ARM1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Patl2A2ARM1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Patl2A2ARM1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Patl2A2ARM1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Patl2A2ARM1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Patl2A2ARM1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Patl2A2ARM1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Patl2A2ARM1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Patl2A2ARM1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Patl2A2ARM1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Patl2A2ARM1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Patl2A2ARM1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Patl2A2ARM1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Patl2A2ARM1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Patl2A2ARM1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Patl2A2ARM1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Patl2A2ARM1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Patl2A2ARM1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Patl2A2ARM1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Patl2A2ARM1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Patl2A2ARM1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Patl2A2ARM1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Patl2A2ARM1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Patl2A2ARM1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Patl2A2ARM1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Patl2A2ARM1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Patl2A2ARM1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Patl2A2ARM1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Patl2A2ARM1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Patl2A2ARM1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Patl2A2ARM1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Patl2A2ARM1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Patl2A2ARM1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Patl2A2ARM1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Patl2A2ARM1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Patl2A2ARM1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Patl2A2ARM1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Patl2A2ARM1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Patl2A2ARM1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Patl2A2ARM1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Patl2A2ARM1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Patl2A2ARM1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Patl2A2ARM1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Patl2A2ARM1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Patl2A2ARM1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Patl2A2ARM1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Patl2A2ARM1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Patl2A2ARM1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Patl2A2ARM1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Patl2A2ARM1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Patl2A2ARM1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Patl2A2ARM1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Patl2A2ARM1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Patl2A2ARM1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Patl2A2ARM1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Patl2A2ARM1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Patl2A2ARM1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Patl2A2ARM1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Patl2A2ARM1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Patl2A2ARM1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Patl2A2ARM1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Patl2A2ARM1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Patl2A2ARM1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Patl2A2ARM1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Patl2A2ARM1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Patl2A2ARM1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Patl2A2ARM1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Patl2A2ARM1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Patl2A2ARM1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Patl2A2ARM1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Patl2A2ARM1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Patl2A2ARM1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Patl2A2ARM1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Patl2A2ARM1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Patl2A2ARM1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Patl2A2ARM1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms