Protein–RNA interactions for Protein: A2AJW5

Fam217b, Family with sequence similarity 217, member B, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam217bA2AJW5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam217bA2AJW5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fam217bA2AJW5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fam217bA2AJW5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fam217bA2AJW5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam217bA2AJW5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam217bA2AJW5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam217bA2AJW5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam217bA2AJW5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam217bA2AJW5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam217bA2AJW5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam217bA2AJW5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam217bA2AJW5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam217bA2AJW5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam217bA2AJW5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam217bA2AJW5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam217bA2AJW5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam217bA2AJW5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam217bA2AJW5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam217bA2AJW5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam217bA2AJW5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam217bA2AJW5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam217bA2AJW5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam217bA2AJW5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam217bA2AJW5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam217bA2AJW5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam217bA2AJW5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam217bA2AJW5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam217bA2AJW5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam217bA2AJW5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam217bA2AJW5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam217bA2AJW5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam217bA2AJW5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam217bA2AJW5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam217bA2AJW5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam217bA2AJW5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Fam217bA2AJW5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam217bA2AJW5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam217bA2AJW5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam217bA2AJW5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam217bA2AJW5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam217bA2AJW5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam217bA2AJW5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam217bA2AJW5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam217bA2AJW5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam217bA2AJW5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam217bA2AJW5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam217bA2AJW5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam217bA2AJW5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam217bA2AJW5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam217bA2AJW5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam217bA2AJW5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam217bA2AJW5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam217bA2AJW5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam217bA2AJW5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam217bA2AJW5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam217bA2AJW5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam217bA2AJW5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam217bA2AJW5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam217bA2AJW5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam217bA2AJW5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam217bA2AJW5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam217bA2AJW5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam217bA2AJW5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam217bA2AJW5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam217bA2AJW5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam217bA2AJW5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam217bA2AJW5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam217bA2AJW5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam217bA2AJW5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam217bA2AJW5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam217bA2AJW5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam217bA2AJW5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam217bA2AJW5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam217bA2AJW5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam217bA2AJW5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam217bA2AJW5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam217bA2AJW5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam217bA2AJW5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam217bA2AJW5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam217bA2AJW5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam217bA2AJW5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam217bA2AJW5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam217bA2AJW5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam217bA2AJW5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam217bA2AJW5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam217bA2AJW5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam217bA2AJW5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam217bA2AJW5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam217bA2AJW5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam217bA2AJW5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam217bA2AJW5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam217bA2AJW5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam217bA2AJW5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam217bA2AJW5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam217bA2AJW5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam217bA2AJW5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam217bA2AJW5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam217bA2AJW5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam217bA2AJW5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms