Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rhbdl2A2AGA4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rhbdl2A2AGA4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhbdl2A2AGA4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhbdl2A2AGA4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhbdl2A2AGA4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhbdl2A2AGA4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhbdl2A2AGA4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhbdl2A2AGA4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhbdl2A2AGA4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhbdl2A2AGA4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhbdl2A2AGA4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhbdl2A2AGA4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhbdl2A2AGA4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhbdl2A2AGA4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhbdl2A2AGA4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhbdl2A2AGA4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhbdl2A2AGA4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhbdl2A2AGA4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhbdl2A2AGA4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhbdl2A2AGA4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhbdl2A2AGA4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhbdl2A2AGA4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhbdl2A2AGA4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhbdl2A2AGA4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rhbdl2A2AGA4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rhbdl2A2AGA4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rhbdl2A2AGA4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rhbdl2A2AGA4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rhbdl2A2AGA4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhbdl2A2AGA4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhbdl2A2AGA4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhbdl2A2AGA4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhbdl2A2AGA4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhbdl2A2AGA4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhbdl2A2AGA4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhbdl2A2AGA4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhbdl2A2AGA4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhbdl2A2AGA4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhbdl2A2AGA4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhbdl2A2AGA4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhbdl2A2AGA4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhbdl2A2AGA4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhbdl2A2AGA4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhbdl2A2AGA4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhbdl2A2AGA4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhbdl2A2AGA4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhbdl2A2AGA4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhbdl2A2AGA4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhbdl2A2AGA4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhbdl2A2AGA4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhbdl2A2AGA4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhbdl2A2AGA4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhbdl2A2AGA4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhbdl2A2AGA4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rhbdl2A2AGA4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhbdl2A2AGA4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhbdl2A2AGA4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhbdl2A2AGA4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhbdl2A2AGA4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhbdl2A2AGA4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhbdl2A2AGA4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhbdl2A2AGA4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhbdl2A2AGA4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhbdl2A2AGA4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhbdl2A2AGA4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhbdl2A2AGA4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhbdl2A2AGA4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhbdl2A2AGA4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhbdl2A2AGA4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhbdl2A2AGA4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhbdl2A2AGA4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhbdl2A2AGA4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhbdl2A2AGA4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhbdl2A2AGA4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhbdl2A2AGA4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhbdl2A2AGA4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhbdl2A2AGA4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhbdl2A2AGA4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhbdl2A2AGA4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhbdl2A2AGA4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhbdl2A2AGA4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhbdl2A2AGA4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhbdl2A2AGA4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rhbdl2A2AGA4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rhbdl2A2AGA4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rhbdl2A2AGA4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rhbdl2A2AGA4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rhbdl2A2AGA4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rhbdl2A2AGA4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rhbdl2A2AGA4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rhbdl2A2AGA4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rhbdl2A2AGA4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rhbdl2A2AGA4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhbdl2A2AGA4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhbdl2A2AGA4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhbdl2A2AGA4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhbdl2A2AGA4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhbdl2A2AGA4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rhbdl2A2AGA4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms