Protein–RNA interactions for Protein: A0A1L1SQF0

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1L1SQF0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
A0A1L1SQF0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
A0A1L1SQF0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
A0A1L1SQF0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
A0A1L1SQF0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
A0A1L1SQF0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
A0A1L1SQF0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
A0A1L1SQF0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
A0A1L1SQF0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
A0A1L1SQF0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
A0A1L1SQF0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
A0A1L1SQF0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
A0A1L1SQF0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
A0A1L1SQF0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
A0A1L1SQF0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
A0A1L1SQF0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
A0A1L1SQF0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
A0A1L1SQF0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
A0A1L1SQF0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
A0A1L1SQF0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
A0A1L1SQF0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
A0A1L1SQF0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
A0A1L1SQF0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
A0A1L1SQF0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
A0A1L1SQF0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
A0A1L1SQF0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
A0A1L1SQF0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
A0A1L1SQF0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
A0A1L1SQF0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
A0A1L1SQF0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
A0A1L1SQF0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
A0A1L1SQF0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A1L1SQF0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A1L1SQF0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A1L1SQF0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A1L1SQF0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A1L1SQF0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
A0A1L1SQF0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
A0A1L1SQF0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
A0A1L1SQF0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
A0A1L1SQF0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
A0A1L1SQF0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
A0A1L1SQF0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
A0A1L1SQF0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
A0A1L1SQF0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
A0A1L1SQF0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
A0A1L1SQF0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
A0A1L1SQF0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
A0A1L1SQF0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
A0A1L1SQF0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
A0A1L1SQF0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
A0A1L1SQF0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
A0A1L1SQF0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A1L1SQF0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A1L1SQF0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A1L1SQF0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A1L1SQF0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A1L1SQF0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
A0A1L1SQF0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
A0A1L1SQF0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
A0A1L1SQF0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
A0A1L1SQF0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
A0A1L1SQF0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
A0A1L1SQF0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
A0A1L1SQF0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
A0A1L1SQF0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
A0A1L1SQF0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
A0A1L1SQF0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
A0A1L1SQF0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
A0A1L1SQF0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
A0A1L1SQF0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
A0A1L1SQF0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
A0A1L1SQF0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
A0A1L1SQF0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
A0A1L1SQF0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
A0A1L1SQF0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
A0A1L1SQF0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
A0A1L1SQF0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
A0A1L1SQF0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
A0A1L1SQF0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
A0A1L1SQF0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
A0A1L1SQF0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
A0A1L1SQF0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
A0A1L1SQF0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
A0A1L1SQF0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
A0A1L1SQF0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
A0A1L1SQF0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
A0A1L1SQF0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
A0A1L1SQF0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
A0A1L1SQF0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
A0A1L1SQF0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
A0A1L1SQF0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
A0A1L1SQF0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
A0A1L1SQF0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
A0A1L1SQF0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
A0A1L1SQF0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
A0A1L1SQF0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
A0A1L1SQF0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
A0A1L1SQF0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
A0A1L1SQF0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms