Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQ45

6430628N08Rik, MCG1049118, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
6430628N08RikA0A0U1RQ45 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
6430628N08RikA0A0U1RQ45 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
6430628N08RikA0A0U1RQ45 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
6430628N08RikA0A0U1RQ45 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
6430628N08RikA0A0U1RQ45 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
6430628N08RikA0A0U1RQ45 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
6430628N08RikA0A0U1RQ45 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
6430628N08RikA0A0U1RQ45 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
6430628N08RikA0A0U1RQ45 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
6430628N08RikA0A0U1RQ45 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms