Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms