Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WR25

Gm28360, Predicted gene 28360, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28360A0A087WR25 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm28360A0A087WR25 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm28360A0A087WR25 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm28360A0A087WR25 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm28360A0A087WR25 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm28360A0A087WR25 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm28360A0A087WR25 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm28360A0A087WR25 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm28360A0A087WR25 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm28360A0A087WR25 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm28360A0A087WR25 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm28360A0A087WR25 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm28360A0A087WR25 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm28360A0A087WR25 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm28360A0A087WR25 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm28360A0A087WR25 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm28360A0A087WR25 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm28360A0A087WR25 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm28360A0A087WR25 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm28360A0A087WR25 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm28360A0A087WR25 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm28360A0A087WR25 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm28360A0A087WR25 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm28360A0A087WR25 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm28360A0A087WR25 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm28360A0A087WR25 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm28360A0A087WR25 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm28360A0A087WR25 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm28360A0A087WR25 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm28360A0A087WR25 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm28360A0A087WR25 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm28360A0A087WR25 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm28360A0A087WR25 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm28360A0A087WR25 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm28360A0A087WR25 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm28360A0A087WR25 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm28360A0A087WR25 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm28360A0A087WR25 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm28360A0A087WR25 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm28360A0A087WR25 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm28360A0A087WR25 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm28360A0A087WR25 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm28360A0A087WR25 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm28360A0A087WR25 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm28360A0A087WR25 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm28360A0A087WR25 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm28360A0A087WR25 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm28360A0A087WR25 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm28360A0A087WR25 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm28360A0A087WR25 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm28360A0A087WR25 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm28360A0A087WR25 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm28360A0A087WR25 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm28360A0A087WR25 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm28360A0A087WR25 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm28360A0A087WR25 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm28360A0A087WR25 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm28360A0A087WR25 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm28360A0A087WR25 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm28360A0A087WR25 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm28360A0A087WR25 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm28360A0A087WR25 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm28360A0A087WR25 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm28360A0A087WR25 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm28360A0A087WR25 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm28360A0A087WR25 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm28360A0A087WR25 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm28360A0A087WR25 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm28360A0A087WR25 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm28360A0A087WR25 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm28360A0A087WR25 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm28360A0A087WR25 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm28360A0A087WR25 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm28360A0A087WR25 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm28360A0A087WR25 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm28360A0A087WR25 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm28360A0A087WR25 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm28360A0A087WR25 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm28360A0A087WR25 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm28360A0A087WR25 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm28360A0A087WR25 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm28360A0A087WR25 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm28360A0A087WR25 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm28360A0A087WR25 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm28360A0A087WR25 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm28360A0A087WR25 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm28360A0A087WR25 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm28360A0A087WR25 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm28360A0A087WR25 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm28360A0A087WR25 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm28360A0A087WR25 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm28360A0A087WR25 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm28360A0A087WR25 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm28360A0A087WR25 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm28360A0A087WR25 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm28360A0A087WR25 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm28360A0A087WR25 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm28360A0A087WR25 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm28360A0A087WR25 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm28360A0A087WR25 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
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