Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQ19

Gm28171, Predicted gene 28171, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28171A0A087WQ19 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28171A0A087WQ19 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28171A0A087WQ19 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28171A0A087WQ19 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28171A0A087WQ19 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28171A0A087WQ19 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28171A0A087WQ19 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm28171A0A087WQ19 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm28171A0A087WQ19 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm28171A0A087WQ19 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm28171A0A087WQ19 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm28171A0A087WQ19 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm28171A0A087WQ19 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm28171A0A087WQ19 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm28171A0A087WQ19 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm28171A0A087WQ19 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm28171A0A087WQ19 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm28171A0A087WQ19 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm28171A0A087WQ19 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm28171A0A087WQ19 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm28171A0A087WQ19 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm28171A0A087WQ19 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm28171A0A087WQ19 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm28171A0A087WQ19 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm28171A0A087WQ19 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm28171A0A087WQ19 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm28171A0A087WQ19 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm28171A0A087WQ19 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm28171A0A087WQ19 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm28171A0A087WQ19 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm28171A0A087WQ19 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm28171A0A087WQ19 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm28171A0A087WQ19 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm28171A0A087WQ19 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm28171A0A087WQ19 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm28171A0A087WQ19 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm28171A0A087WQ19 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm28171A0A087WQ19 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm28171A0A087WQ19 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm28171A0A087WQ19 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm28171A0A087WQ19 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm28171A0A087WQ19 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm28171A0A087WQ19 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm28171A0A087WQ19 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm28171A0A087WQ19 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm28171A0A087WQ19 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm28171A0A087WQ19 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm28171A0A087WQ19 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm28171A0A087WQ19 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm28171A0A087WQ19 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm28171A0A087WQ19 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm28171A0A087WQ19 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm28171A0A087WQ19 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm28171A0A087WQ19 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm28171A0A087WQ19 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm28171A0A087WQ19 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm28171A0A087WQ19 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm28171A0A087WQ19 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm28171A0A087WQ19 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm28171A0A087WQ19 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm28171A0A087WQ19 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm28171A0A087WQ19 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm28171A0A087WQ19 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm28171A0A087WQ19 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm28171A0A087WQ19 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm28171A0A087WQ19 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm28171A0A087WQ19 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm28171A0A087WQ19 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm28171A0A087WQ19 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm28171A0A087WQ19 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm28171A0A087WQ19 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm28171A0A087WQ19 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm28171A0A087WQ19 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm28171A0A087WQ19 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm28171A0A087WQ19 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm28171A0A087WQ19 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm28171A0A087WQ19 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm28171A0A087WQ19 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm28171A0A087WQ19 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm28171A0A087WQ19 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm28171A0A087WQ19 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm28171A0A087WQ19 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm28171A0A087WQ19 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm28171A0A087WQ19 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm28171A0A087WQ19 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm28171A0A087WQ19 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm28171A0A087WQ19 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm28171A0A087WQ19 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm28171A0A087WQ19 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm28171A0A087WQ19 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm28171A0A087WQ19 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm28171A0A087WQ19 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm28171A0A087WQ19 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm28171A0A087WQ19 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm28171A0A087WQ19 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm28171A0A087WQ19 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm28171A0A087WQ19 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm28171A0A087WQ19 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm28171A0A087WQ19 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm28171A0A087WQ19 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms