Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WP46

BC034090, cDNA sequence BC034090, mousemouse

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Length 1,202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC034090A0A087WP46 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
BC034090A0A087WP46 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BC034090A0A087WP46 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BC034090A0A087WP46 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BC034090A0A087WP46 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BC034090A0A087WP46 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
BC034090A0A087WP46 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
BC034090A0A087WP46 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
BC034090A0A087WP46 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BC034090A0A087WP46 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BC034090A0A087WP46 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BC034090A0A087WP46 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BC034090A0A087WP46 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BC034090A0A087WP46 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BC034090A0A087WP46 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BC034090A0A087WP46 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BC034090A0A087WP46 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BC034090A0A087WP46 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BC034090A0A087WP46 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BC034090A0A087WP46 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BC034090A0A087WP46 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BC034090A0A087WP46 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BC034090A0A087WP46 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BC034090A0A087WP46 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BC034090A0A087WP46 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BC034090A0A087WP46 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BC034090A0A087WP46 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BC034090A0A087WP46 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BC034090A0A087WP46 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BC034090A0A087WP46 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BC034090A0A087WP46 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BC034090A0A087WP46 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BC034090A0A087WP46 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BC034090A0A087WP46 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BC034090A0A087WP46 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BC034090A0A087WP46 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BC034090A0A087WP46 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BC034090A0A087WP46 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BC034090A0A087WP46 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BC034090A0A087WP46 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BC034090A0A087WP46 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BC034090A0A087WP46 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BC034090A0A087WP46 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BC034090A0A087WP46 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BC034090A0A087WP46 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BC034090A0A087WP46 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BC034090A0A087WP46 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BC034090A0A087WP46 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BC034090A0A087WP46 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
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BC034090A0A087WP46 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BC034090A0A087WP46 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BC034090A0A087WP46 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BC034090A0A087WP46 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BC034090A0A087WP46 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
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BC034090A0A087WP46 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BC034090A0A087WP46 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BC034090A0A087WP46 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BC034090A0A087WP46 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
BC034090A0A087WP46 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BC034090A0A087WP46 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BC034090A0A087WP46 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BC034090A0A087WP46 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BC034090A0A087WP46 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BC034090A0A087WP46 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BC034090A0A087WP46 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BC034090A0A087WP46 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BC034090A0A087WP46 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BC034090A0A087WP46 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BC034090A0A087WP46 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BC034090A0A087WP46 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BC034090A0A087WP46 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BC034090A0A087WP46 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BC034090A0A087WP46 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BC034090A0A087WP46 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BC034090A0A087WP46 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
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BC034090A0A087WP46 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BC034090A0A087WP46 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BC034090A0A087WP46 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BC034090A0A087WP46 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BC034090A0A087WP46 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BC034090A0A087WP46 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BC034090A0A087WP46 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BC034090A0A087WP46 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BC034090A0A087WP46 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BC034090A0A087WP46 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BC034090A0A087WP46 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BC034090A0A087WP46 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BC034090A0A087WP46 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BC034090A0A087WP46 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BC034090A0A087WP46 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BC034090A0A087WP46 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BC034090A0A087WP46 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BC034090A0A087WP46 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BC034090A0A087WP46 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BC034090A0A087WP46 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BC034090A0A087WP46 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
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