Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WP28

Gm28510, Predicted gene 28510, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28510A0A087WP28 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm28510A0A087WP28 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm28510A0A087WP28 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm28510A0A087WP28 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm28510A0A087WP28 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm28510A0A087WP28 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm28510A0A087WP28 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm28510A0A087WP28 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm28510A0A087WP28 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm28510A0A087WP28 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm28510A0A087WP28 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm28510A0A087WP28 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm28510A0A087WP28 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm28510A0A087WP28 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm28510A0A087WP28 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm28510A0A087WP28 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm28510A0A087WP28 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm28510A0A087WP28 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm28510A0A087WP28 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm28510A0A087WP28 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm28510A0A087WP28 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm28510A0A087WP28 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm28510A0A087WP28 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm28510A0A087WP28 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm28510A0A087WP28 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm28510A0A087WP28 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm28510A0A087WP28 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm28510A0A087WP28 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm28510A0A087WP28 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm28510A0A087WP28 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm28510A0A087WP28 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm28510A0A087WP28 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm28510A0A087WP28 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm28510A0A087WP28 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm28510A0A087WP28 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm28510A0A087WP28 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm28510A0A087WP28 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm28510A0A087WP28 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gm28510A0A087WP28 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm28510A0A087WP28 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm28510A0A087WP28 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm28510A0A087WP28 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm28510A0A087WP28 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm28510A0A087WP28 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm28510A0A087WP28 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm28510A0A087WP28 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm28510A0A087WP28 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm28510A0A087WP28 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm28510A0A087WP28 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm28510A0A087WP28 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm28510A0A087WP28 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm28510A0A087WP28 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm28510A0A087WP28 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm28510A0A087WP28 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm28510A0A087WP28 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm28510A0A087WP28 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm28510A0A087WP28 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm28510A0A087WP28 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm28510A0A087WP28 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm28510A0A087WP28 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm28510A0A087WP28 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm28510A0A087WP28 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm28510A0A087WP28 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm28510A0A087WP28 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm28510A0A087WP28 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm28510A0A087WP28 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm28510A0A087WP28 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm28510A0A087WP28 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gm28510A0A087WP28 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm28510A0A087WP28 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm28510A0A087WP28 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm28510A0A087WP28 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm28510A0A087WP28 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm28510A0A087WP28 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm28510A0A087WP28 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm28510A0A087WP28 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm28510A0A087WP28 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm28510A0A087WP28 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm28510A0A087WP28 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm28510A0A087WP28 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm28510A0A087WP28 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm28510A0A087WP28 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm28510A0A087WP28 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm28510A0A087WP28 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm28510A0A087WP28 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm28510A0A087WP28 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm28510A0A087WP28 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm28510A0A087WP28 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm28510A0A087WP28 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm28510A0A087WP28 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm28510A0A087WP28 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm28510A0A087WP28 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm28510A0A087WP28 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm28510A0A087WP28 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm28510A0A087WP28 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm28510A0A087WP28 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm28510A0A087WP28 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm28510A0A087WP28 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm28510A0A087WP28 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm28510A0A087WP28 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms