Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5I2

Trbv4, T cell receptor beta, variable 10 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv4A0A075B5I2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trbv4A0A075B5I2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trbv4A0A075B5I2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trbv4A0A075B5I2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trbv4A0A075B5I2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trbv4A0A075B5I2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trbv4A0A075B5I2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trbv4A0A075B5I2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trbv4A0A075B5I2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trbv4A0A075B5I2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trbv4A0A075B5I2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trbv4A0A075B5I2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trbv4A0A075B5I2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trbv4A0A075B5I2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trbv4A0A075B5I2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Trbv4A0A075B5I2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trbv4A0A075B5I2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trbv4A0A075B5I2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Trbv4A0A075B5I2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trbv4A0A075B5I2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trbv4A0A075B5I2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trbv4A0A075B5I2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trbv4A0A075B5I2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trbv4A0A075B5I2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trbv4A0A075B5I2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trbv4A0A075B5I2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trbv4A0A075B5I2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trbv4A0A075B5I2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trbv4A0A075B5I2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trbv4A0A075B5I2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trbv4A0A075B5I2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trbv4A0A075B5I2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trbv4A0A075B5I2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trbv4A0A075B5I2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trbv4A0A075B5I2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trbv4A0A075B5I2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trbv4A0A075B5I2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trbv4A0A075B5I2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trbv4A0A075B5I2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trbv4A0A075B5I2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trbv4A0A075B5I2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trbv4A0A075B5I2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trbv4A0A075B5I2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trbv4A0A075B5I2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trbv4A0A075B5I2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trbv4A0A075B5I2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Trbv4A0A075B5I2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trbv4A0A075B5I2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trbv4A0A075B5I2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trbv4A0A075B5I2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trbv4A0A075B5I2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trbv4A0A075B5I2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Trbv4A0A075B5I2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trbv4A0A075B5I2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Trbv4A0A075B5I2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trbv4A0A075B5I2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trbv4A0A075B5I2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trbv4A0A075B5I2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trbv4A0A075B5I2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trbv4A0A075B5I2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trbv4A0A075B5I2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trbv4A0A075B5I2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trbv4A0A075B5I2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trbv4A0A075B5I2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trbv4A0A075B5I2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trbv4A0A075B5I2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trbv4A0A075B5I2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trbv4A0A075B5I2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trbv4A0A075B5I2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trbv4A0A075B5I2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trbv4A0A075B5I2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trbv4A0A075B5I2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trbv4A0A075B5I2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trbv4A0A075B5I2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trbv4A0A075B5I2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trbv4A0A075B5I2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trbv4A0A075B5I2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trbv4A0A075B5I2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trbv4A0A075B5I2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trbv4A0A075B5I2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trbv4A0A075B5I2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Trbv4A0A075B5I2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trbv4A0A075B5I2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trbv4A0A075B5I2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trbv4A0A075B5I2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trbv4A0A075B5I2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trbv4A0A075B5I2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Trbv4A0A075B5I2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trbv4A0A075B5I2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trbv4A0A075B5I2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trbv4A0A075B5I2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trbv4A0A075B5I2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trbv4A0A075B5I2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trbv4A0A075B5I2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trbv4A0A075B5I2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trbv4A0A075B5I2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trbv4A0A075B5I2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trbv4A0A075B5I2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trbv4A0A075B5I2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trbv4A0A075B5I2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
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