Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPN13Q12923 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
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