Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Psme1P97371 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Psme1P97371 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Psme1P97371 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Psme1P97371 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Psme1P97371 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psme1P97371 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms