Protein–RNA interactions for Protein: B1AXP3

Saxo1, MCG1697, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saxo1B1AXP3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Saxo1B1AXP3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Saxo1B1AXP3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Saxo1B1AXP3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Saxo1B1AXP3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms