Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 AC104574.1-201ENST00000561182 925 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPN13Q12923 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
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