Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC103968.1-201ENST00000557841 573 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 AC112496.1-201ENST00000497961 562 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
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PTPN13Q12923 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
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PTPN13Q12923 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPN13Q12923 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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