Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Rpp30-201ENSMUST00000025714 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ms4a4bQ9ES61 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ms4a4bQ9ES61 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms