Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms