Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI2

Slc44a5, Choline transporter-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a5Q5RJI2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Slc44a5Q5RJI2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc44a5Q5RJI2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc44a5Q5RJI2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc44a5Q5RJI2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc44a5Q5RJI2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc44a5Q5RJI2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc44a5Q5RJI2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc44a5Q5RJI2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc44a5Q5RJI2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc44a5Q5RJI2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc44a5Q5RJI2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc44a5Q5RJI2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc44a5Q5RJI2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc44a5Q5RJI2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc44a5Q5RJI2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc44a5Q5RJI2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc44a5Q5RJI2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc44a5Q5RJI2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc44a5Q5RJI2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc44a5Q5RJI2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc44a5Q5RJI2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc44a5Q5RJI2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc44a5Q5RJI2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc44a5Q5RJI2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc44a5Q5RJI2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc44a5Q5RJI2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc44a5Q5RJI2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc44a5Q5RJI2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc44a5Q5RJI2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc44a5Q5RJI2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc44a5Q5RJI2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc44a5Q5RJI2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms