Protein–RNA interactions for Protein: P70325

Tbx4, T-box transcription factor TBX4, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx4P70325 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbx4P70325 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms