Protein–RNA interactions for Protein: P41230

Kdm5c, Lysine-specific demethylase 5C, mousemouse

Predictions only

Length 1,554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5cP41230 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kdm5cP41230 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Kdm5cP41230 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Kdm5cP41230 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms