Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kif3aP28741 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.4 ms