Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prf1P10820 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Prf1P10820 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prf1P10820 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prf1P10820 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prf1P10820 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prf1P10820 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prf1P10820 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms