Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
NipblQ6KCD5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC12.46□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NipblQ6KCD5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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