Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms