Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pfdn6Q03958 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pfdn6Q03958 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pfdn6Q03958 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pfdn6Q03958 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pfdn6Q03958 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pfdn6Q03958 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn6Q03958 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn6Q03958 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn6Q03958 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn6Q03958 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn6Q03958 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn6Q03958 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn6Q03958 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn6Q03958 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn6Q03958 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn6Q03958 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn6Q03958 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn6Q03958 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn6Q03958 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn6Q03958 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn6Q03958 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn6Q03958 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn6Q03958 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn6Q03958 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfdn6Q03958 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pfdn6Q03958 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pfdn6Q03958 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pfdn6Q03958 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pfdn6Q03958 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pfdn6Q03958 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pfdn6Q03958 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pfdn6Q03958 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pfdn6Q03958 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pfdn6Q03958 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pfdn6Q03958 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pfdn6Q03958 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pfdn6Q03958 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pfdn6Q03958 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pfdn6Q03958 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pfdn6Q03958 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfdn6Q03958 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfdn6Q03958 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfdn6Q03958 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfdn6Q03958 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfdn6Q03958 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfdn6Q03958 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfdn6Q03958 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfdn6Q03958 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfdn6Q03958 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfdn6Q03958 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfdn6Q03958 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfdn6Q03958 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfdn6Q03958 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfdn6Q03958 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfdn6Q03958 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfdn6Q03958 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfdn6Q03958 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfdn6Q03958 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfdn6Q03958 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms