Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhoP15409 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhoP15409 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhoP15409 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhoP15409 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhoP15409 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhoP15409 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhoP15409 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhoP15409 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhoP15409 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhoP15409 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhoP15409 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhoP15409 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhoP15409 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhoP15409 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RhoP15409 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RhoP15409 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhoP15409 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhoP15409 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhoP15409 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhoP15409 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhoP15409 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhoP15409 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhoP15409 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhoP15409 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhoP15409 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhoP15409 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhoP15409 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhoP15409 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhoP15409 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhoP15409 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RhoP15409 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhoP15409 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhoP15409 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhoP15409 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhoP15409 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhoP15409 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhoP15409 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhoP15409 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhoP15409 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhoP15409 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhoP15409 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhoP15409 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhoP15409 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhoP15409 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhoP15409 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhoP15409 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhoP15409 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RhoP15409 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhoP15409 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhoP15409 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhoP15409 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhoP15409 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhoP15409 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhoP15409 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhoP15409 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhoP15409 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RhoP15409 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhoP15409 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhoP15409 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RhoP15409 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RhoP15409 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RhoP15409 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RhoP15409 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RhoP15409 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RhoP15409 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RhoP15409 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RhoP15409 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RhoP15409 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RhoP15409 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RhoP15409 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RhoP15409 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RhoP15409 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RhoP15409 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RhoP15409 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RhoP15409 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RhoP15409 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RhoP15409 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhoP15409 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhoP15409 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhoP15409 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhoP15409 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhoP15409 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhoP15409 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhoP15409 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhoP15409 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhoP15409 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhoP15409 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhoP15409 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhoP15409 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RhoP15409 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhoP15409 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhoP15409 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhoP15409 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhoP15409 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RhoP15409 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RhoP15409 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhoP15409 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhoP15409 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhoP15409 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms