Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
1700019A02RikA0A087WPV9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
1700019A02RikA0A087WPV9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
1700019A02RikA0A087WPV9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
1700019A02RikA0A087WPV9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
1700019A02RikA0A087WPV9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
1700019A02RikA0A087WPV9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
1700019A02RikA0A087WPV9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
1700019A02RikA0A087WPV9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
1700019A02RikA0A087WPV9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
1700019A02RikA0A087WPV9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
1700019A02RikA0A087WPV9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
1700019A02RikA0A087WPV9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
1700019A02RikA0A087WPV9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
1700019A02RikA0A087WPV9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
1700019A02RikA0A087WPV9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
1700019A02RikA0A087WPV9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
1700019A02RikA0A087WPV9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
1700019A02RikA0A087WPV9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
1700019A02RikA0A087WPV9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
1700019A02RikA0A087WPV9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
1700019A02RikA0A087WPV9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
1700019A02RikA0A087WPV9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
1700019A02RikA0A087WPV9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 518.2 ms