Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG1

Edf1, Endothelial differentiation-related factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edf1Q9JMG1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Edf1Q9JMG1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Edf1Q9JMG1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Edf1Q9JMG1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Edf1Q9JMG1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Edf1Q9JMG1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Edf1Q9JMG1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Edf1Q9JMG1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Edf1Q9JMG1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Edf1Q9JMG1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Edf1Q9JMG1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Edf1Q9JMG1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Edf1Q9JMG1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Edf1Q9JMG1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Edf1Q9JMG1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Edf1Q9JMG1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Edf1Q9JMG1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Edf1Q9JMG1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Edf1Q9JMG1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Edf1Q9JMG1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Edf1Q9JMG1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Edf1Q9JMG1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Edf1Q9JMG1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Edf1Q9JMG1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Edf1Q9JMG1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Edf1Q9JMG1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Edf1Q9JMG1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Edf1Q9JMG1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Edf1Q9JMG1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Edf1Q9JMG1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Edf1Q9JMG1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms