Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR59

Gadd45gip1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45gip1Q9CR59 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gadd45gip1Q9CR59 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms