Protein–RNA interactions for Protein: Q5XJY5

Arcn1, Coatomer subunit delta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arcn1Q5XJY5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arcn1Q5XJY5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arcn1Q5XJY5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arcn1Q5XJY5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms