Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psme1P97371 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psme1P97371 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psme1P97371 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psme1P97371 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psme1P97371 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psme1P97371 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psme1P97371 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psme1P97371 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psme1P97371 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psme1P97371 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psme1P97371 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psme1P97371 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Psme1P97371 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psme1P97371 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psme1P97371 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psme1P97371 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psme1P97371 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psme1P97371 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psme1P97371 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psme1P97371 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psme1P97371 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psme1P97371 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psme1P97371 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Psme1P97371 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Psme1P97371 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psme1P97371 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psme1P97371 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms