Protein–RNA interactions for Protein: P41230

Kdm5c, Lysine-specific demethylase 5C, mousemouse

Predictions only

Length 1,554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5cP41230 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Kdm5cP41230 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kdm5cP41230 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kdm5cP41230 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kdm5cP41230 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kdm5cP41230 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kdm5cP41230 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kdm5cP41230 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kdm5cP41230 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kdm5cP41230 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Kdm5cP41230 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5cP41230 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5cP41230 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5cP41230 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5cP41230 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5cP41230 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5cP41230 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5cP41230 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5cP41230 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5cP41230 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5cP41230 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5cP41230 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5cP41230 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5cP41230 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5cP41230 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms