Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RhoP15409 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RhoP15409 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RhoP15409 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RhoP15409 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RhoP15409 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RhoP15409 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RhoP15409 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RhoP15409 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RhoP15409 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RhoP15409 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RhoP15409 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RhoP15409 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RhoP15409 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RhoP15409 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RhoP15409 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RhoP15409 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RhoP15409 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RhoP15409 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RhoP15409 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RhoP15409 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RhoP15409 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RhoP15409 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RhoP15409 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RhoP15409 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RhoP15409 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RhoP15409 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RhoP15409 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RhoP15409 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RhoP15409 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RhoP15409 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RhoP15409 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RhoP15409 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RhoP15409 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RhoP15409 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RhoP15409 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RhoP15409 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RhoP15409 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RhoP15409 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RhoP15409 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RhoP15409 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RhoP15409 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RhoP15409 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RhoP15409 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RhoP15409 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RhoP15409 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RhoP15409 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RhoP15409 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RhoP15409 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RhoP15409 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RhoP15409 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RhoP15409 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhoP15409 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhoP15409 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhoP15409 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhoP15409 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhoP15409 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhoP15409 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhoP15409 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhoP15409 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhoP15409 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhoP15409 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhoP15409 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhoP15409 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhoP15409 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhoP15409 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhoP15409 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhoP15409 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhoP15409 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhoP15409 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhoP15409 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhoP15409 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhoP15409 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhoP15409 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhoP15409 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhoP15409 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhoP15409 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhoP15409 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhoP15409 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhoP15409 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhoP15409 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RhoP15409 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RhoP15409 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhoP15409 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhoP15409 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RhoP15409 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhoP15409 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RhoP15409 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RhoP15409 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhoP15409 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhoP15409 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhoP15409 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RhoP15409 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhoP15409 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhoP15409 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhoP15409 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhoP15409 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhoP15409 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhoP15409 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhoP15409 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms