Protein–RNA interactions for Protein: P09405

Ncl, Nucleolin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NclP09405 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NclP09405 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NclP09405 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NclP09405 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NclP09405 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NclP09405 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NclP09405 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NclP09405 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NclP09405 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NclP09405 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NclP09405 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NclP09405 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NclP09405 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NclP09405 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NclP09405 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NclP09405 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NclP09405 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NclP09405 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NclP09405 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NclP09405 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NclP09405 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NclP09405 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NclP09405 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NclP09405 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NclP09405 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NclP09405 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NclP09405 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NclP09405 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NclP09405 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NclP09405 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NclP09405 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NclP09405 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NclP09405 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NclP09405 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NclP09405 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NclP09405 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NclP09405 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NclP09405 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NclP09405 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NclP09405 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NclP09405 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NclP09405 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NclP09405 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NclP09405 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NclP09405 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NclP09405 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NclP09405 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NclP09405 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NclP09405 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NclP09405 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NclP09405 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NclP09405 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NclP09405 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NclP09405 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NclP09405 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NclP09405 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NclP09405 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NclP09405 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NclP09405 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NclP09405 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NclP09405 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NclP09405 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NclP09405 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NclP09405 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NclP09405 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NclP09405 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NclP09405 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NclP09405 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NclP09405 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NclP09405 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NclP09405 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NclP09405 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NclP09405 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NclP09405 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NclP09405 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NclP09405 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NclP09405 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NclP09405 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NclP09405 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NclP09405 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NclP09405 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NclP09405 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NclP09405 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NclP09405 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NclP09405 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NclP09405 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NclP09405 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NclP09405 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NclP09405 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NclP09405 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NclP09405 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NclP09405 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NclP09405 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NclP09405 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NclP09405 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NclP09405 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NclP09405 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NclP09405 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NclP09405 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NclP09405 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms