Protein–RNA interactions for Protein: J3QNS5

Mfsd4b4, Major facilitator superfamily domain-containing 4B4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4b4J3QNS5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mfsd4b4J3QNS5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms