Protein–RNA interactions for Protein: Q9R000

Itgb1bp2, Integrin beta-1-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1bp2Q9R000 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb1bp2Q9R000 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb1bp2Q9R000 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb1bp2Q9R000 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb1bp2Q9R000 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb1bp2Q9R000 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb1bp2Q9R000 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb1bp2Q9R000 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb1bp2Q9R000 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb1bp2Q9R000 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb1bp2Q9R000 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb1bp2Q9R000 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb1bp2Q9R000 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb1bp2Q9R000 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb1bp2Q9R000 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb1bp2Q9R000 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb1bp2Q9R000 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb1bp2Q9R000 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb1bp2Q9R000 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb1bp2Q9R000 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb1bp2Q9R000 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb1bp2Q9R000 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb1bp2Q9R000 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms