Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hmgn5Q9JL35 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hmgn5Q9JL35 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hmgn5Q9JL35 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hmgn5Q9JL35 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hmgn5Q9JL35 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hmgn5Q9JL35 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hmgn5Q9JL35 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hmgn5Q9JL35 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hmgn5Q9JL35 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hmgn5Q9JL35 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hmgn5Q9JL35 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hmgn5Q9JL35 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hmgn5Q9JL35 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hmgn5Q9JL35 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hmgn5Q9JL35 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hmgn5Q9JL35 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hmgn5Q9JL35 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hmgn5Q9JL35 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hmgn5Q9JL35 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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