Protein–RNA interactions for Protein: Q4VAB4

Cnpy1, Protein canopy homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy1Q4VAB4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnpy1Q4VAB4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms