Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MitfQ08874 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MitfQ08874 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MitfQ08874 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MitfQ08874 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MitfQ08874 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MitfQ08874 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MitfQ08874 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MitfQ08874 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MitfQ08874 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MitfQ08874 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MitfQ08874 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms