Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfdn6Q03958 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.5 ms