Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms