Protein–RNA interactions for Protein: J3QNS5

Mfsd4b4, Major facilitator superfamily domain-containing 4B4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4b4J3QNS5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mfsd4b4J3QNS5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mfsd4b4J3QNS5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mfsd4b4J3QNS5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mfsd4b4J3QNS5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mfsd4b4J3QNS5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mfsd4b4J3QNS5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mfsd4b4J3QNS5 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mfsd4b4J3QNS5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mfsd4b4J3QNS5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mfsd4b4J3QNS5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mfsd4b4J3QNS5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mfsd4b4J3QNS5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mfsd4b4J3QNS5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mfsd4b4J3QNS5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mfsd4b4J3QNS5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mfsd4b4J3QNS5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mfsd4b4J3QNS5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mfsd4b4J3QNS5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mfsd4b4J3QNS5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mfsd4b4J3QNS5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mfsd4b4J3QNS5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mfsd4b4J3QNS5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mfsd4b4J3QNS5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mfsd4b4J3QNS5 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mfsd4b4J3QNS5 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mfsd4b4J3QNS5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.5 ms