Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc30Q8BVF4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms